便攜式近紅外光譜儀除可用于實驗室分析外，還可用于工農業生產過程中的檢測，包括品質分析和質量控制，如原料的快速鑒定，復雜混合物的多組分定量分析。相應的附件或利用專用的在線分析儀，可以實現在線過程分析。
用于食品分析
1、酒制品：葡萄酒(乙醇，含糖量，有機酸，含氮值，pH值等)，白酒(原料中的水分，淀粉，支鏈淀粉，酒醅中的水分，pH值，淀粉和殘糖等)，啤酒(大麥原料中的水分，麥芽糖，啤酒中的乙醇和麥芽糖等)，以及產地鑒別，真偽鑒別等；
2、飲料：咖啡 因，糖分，酸度，果汁真偽鑒別；
3、乳制品：乳糖，脂肪，蛋白質，乳酸，灰分，固體物質；
4、玉米漿：果糖，水分，葡萄糖，多醣類；
5、食用油：脂肪酸，含水量，蛋白質，氧化程度，不飽和程度，真偽鑒別；
6、烘焙食品(餅干，面包)：脂肪，蛋白質，水分，淀粉，面筋等；
7、肉類：蛋白質，脂肪，水分，各種氨基酸，脂肪酸，纖維以及新鮮及冷凍程度，產品種類，真偽鑒別。
便攜式近紅外光譜儀用于農產品分析
1、豆類，小麥，面粉，水稻及其它谷類：脂肪，蛋白質，水分，纖維量，淀粉量，小麥產地，產季鑒別，品質分級，谷物老化程度；
2、煙草作物：尼古丁，水分，總糖，還原糖，多酚類，香料，添加物，產地鑒別，等級分類；
3、咖啡：咖啡 因，水分，綠原酸，產品種類，產地鑒別，品質分級；
4、木材：組織分析，水分，品質分級；
5、水果、蔬菜：糖分，酸度，維生素，水分，纖維素，品質分級，成熟程度；
6、茶葉：水分，茶黃素，油脂，多元酚，氮值，品質分級。
用于化工、紡織、化妝品及藥品分析
1、汽油煉制：辛烷值，芳香族，苯，乙醇，蒸餾值，揮發值，添加劑；
2、高分子及塑料制品：一般物性(密度，粘度，硬度，分子量，結晶度)，OH數目，水分，添加劑，皂化值，共聚合物成分，殘余溶劑量，反應動力學測定，乳化反應進程，樹脂熟化度，回收塑料品分類，Z終成品分級；
3、藥品：主要成分，水分，結晶測試，粉末粒徑分析，氨基酸，糖分，原料鑒定，不純物分析，硬度，分解度，觀察合成反應，混合程序鑒定，塑料包裝鑒別；
4、化學品：純度，水分，觀察合成反應，原料鑒定，有機鹽和無機鹽的鑒別；
5、天然氣：烷類成分分析，水分，總熱含量；
6、紡織品與人造纖維：水分，含棉及聚酯比例，共聚合物成分，加工用添加劑，染料，地毯高分子鑒別；
7、造紙：水分，紙漿頂油酸值，皂比值，紙品添加劑；
8、化妝品：油脂混合物分析，原料純度，香料，蠟成分鑒別，均勻程度；
9、油漆及墨水：原料分析，溶劑純度，色素品質。
用于生物醫學分析
1、血液(全血或血清)：血紅素攜氧量，血糖，尿素酸甘油脂，脂肪酸，膽固醇，蛋白質；
2、細胞病理：癌細胞判別，含水量，溫度變化及酸堿度；
3、發酵反應：乙醇，葡萄糖，乳糖，胺基酸，生物量，細胞密度，甘油，觀察反應變化，反應動力學追蹤；
4、微生物或病毒：菌種鑒定；
5、臨床醫學：血紅素攜氧量，心肌蛋白質，尿結石。
便攜式近紅外光譜儀在其它領域的應用
1、土壤分析：有害化學污染物(汽油及芳香族等)，水分；
2、刑事鑒定：藥品分析，偽 鈔鑒定；
3、化學廢棄物：生物處理反應追蹤，廢棄物含量；
4、煤炭：水分，灰分，品質分級；
5、環保：海洋石油污染分析，湖泊有機物富集。
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